Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rprd2Q6NXI6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rprd2Q6NXI6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms