Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms