Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf6Q6NVF9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpsf6Q6NVF9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms