Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ParpbpQ6IRT3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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