Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt39Q6IFX4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt39Q6IFX4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms