Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms