Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atg9aQ68FE2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg9aQ68FE2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms