Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Sbno1Q689Z5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Sbno1Q689Z5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno1Q689Z5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Sbno1Q689Z5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Sbno1Q689Z5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Sbno1Q689Z5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Sbno1Q689Z5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Sbno1Q689Z5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Sbno1Q689Z5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno1Q689Z5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms