Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc8eQ66JT1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms