Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PatjQ63ZW7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms