Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20865Q62460 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms