Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxa13Q62424 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms