Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SypQ62277 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SypQ62277 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SypQ62277 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SypQ62277 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SypQ62277 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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