Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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