Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ifi47Q61635 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms