Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd1Q61345 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd1Q61345 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms