Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nell2Q61220 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms