Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms