Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik1Q60934 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms