Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Cnot7Q60809 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Cnot7Q60809 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms