Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Klf4Q60793 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf4Q60793 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms