Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stxbp3Q60770 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stxbp3Q60770 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms