Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MarcoQ60754 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms