Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd4Q60688 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms