Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brip1Q5SXJ3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms