Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms