Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms