Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim41Q5NCC3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim41Q5NCC3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim41Q5NCC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms