Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf3Q5HZG4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms