Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc3lQ4KL14 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms