Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc110Q3V125 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc110Q3V125 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms