Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc185Q3V118 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms