Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930596D02RikQ3V0H9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms