Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Garnl3Q3V0G7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Garnl3Q3V0G7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms