Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttc9Q3V038 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9Q3V038 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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