Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hipk4Q3V016 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms