Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn13Q3UW68 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn13Q3UW68 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms