Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc33Q3ULW6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms