Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms