Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx3lQ3UIR3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx3lQ3UIR3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms