Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LbrQ3U9G9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms