Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U6N9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U6N9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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