Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm4dQ3U2K5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms