Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a5Q3TYU2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms