Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf6Q3TWW8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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