Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw18Q3TSA9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw18Q3TSA9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms