Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms