Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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