Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samd12Q0VE29 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd12Q0VE29 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms