Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab42Q0PD08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab42Q0PD08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms